Arrêt maladie en CDD ou intérim : démarches et dates à distinguer

La réponse courte : un arrêt maladie pendant un CDD ou une mission d'intérim se transmet selon la procédure habituelle : la caisse reçoit les volets qui lui sont destinés et l'employeur reçoit le volet prévu pour justifier l'absence. La particularité est organisationnelle : en plus des dates de l'arrêt, garde sous les yeux la date de terme indiquée sur le CDD ou sur le contrat de mission et identifie l'interlocuteur qui gère la paie.

Un contrat à durée déterminée, une mission d'intérim et un CDI n'utilisent pas les mêmes documents de suivi, mais l'arrêt reste un document de santé et d'absence. Cette page ne traite ni de contrôle médical ni de litige professionnel. Pour le cadre général de l'arrêt, consulte notre guide arrêt maladie.

Identifier le bon employeur pour le volet d'absence

En CDD, l'employeur est l'entreprise avec laquelle tu as signé le contrat. En intérim, le contrat de mission est conclu avec l'entreprise de travail temporaire, alors que la mission se déroule dans une entreprise utilisatrice. Pour les documents de paie et d'absence, vérifie le nom indiqué sur ton contrat et tes bulletins. C'est ce repère qui permet de savoir quel service doit recevoir le volet destiné à l'employeur.

Ne te fie pas seulement au lieu où tu travailles au quotidien. Garde le contrat de mission, les relevés d'heures et les coordonnées de l'agence. Lorsque plusieurs missions se succèdent, note aussi précisément la dernière journée effectivement travaillée. Ces éléments servent à reconstituer un calendrier administratif clair sans communiquer le motif médical de l'arrêt.

Deux calendriers à regarder

Le premier calendrier est celui de l'arrêt prescrit par le professionnel de santé. Le second est celui du contrat : date de début, date de fin prévue ou terme de mission. Les mélanger crée souvent des erreurs de paie ou de transmission. Mets les deux sur une même feuille de suivi, avec les dates d'envoi et les accusés de réception disponibles.

Le terme annoncé sur un CDD ou une mission est une donnée contractuelle distincte de l'avis d'arrêt. N'en déduis pas toi-même une conséquence sur la relation de travail. Vérifie le contrat, les messages de l'agence et les informations officielles correspondant à ton statut. Cette prudence évite de transformer une question de calendrier en conclusion juridique personnalisée.

Prévenir sans révéler son état de santé

Le volet destiné à l'employeur justifie l'absence sans détailler le diagnostic. Préviens rapidement le contact habituel de l'entreprise ou de l'agence de ton indisponibilité, puis utilise le canal demandé pour le document. Conserve une copie de ton message et une preuve de transmission. Si tu changes d'adresse pendant l'arrêt, signale-la à la caisse selon les modalités Ameli.

Dans l'intérim, le responsable de mission peut avoir besoin de savoir que tu ne seras pas présent, mais les informations de santé ne lui appartiennent pas. Donne uniquement ce qui est nécessaire à l'organisation de l'absence. L'agence gère ensuite les documents relevant de l'employeur et de la paie.

La paie et les documents à classer

Classe les bulletins précédant l'arrêt, le contrat, les relevés d'heures éventuels et les échanges avec l'agence ou le service paie. Si un document d'attestation est demandé pour l'Assurance Maladie, réponds avec les éléments exacts figurant sur ces pièces. Les missions courtes peuvent rendre ces données moins faciles à retrouver, d'où l'intérêt de les sauvegarder au fil de l'eau.

Une convention collective, un accord d'entreprise ou le contrat de mission peut également prévoir des informations spécifiques sur la rémunération. Ne transpose pas automatiquement les règles d'une mission précédente. Identifie d'abord la convention indiquée sur le bulletin et l'entreprise concernée, puis consulte le texte à jour sur Légifrance si un libellé doit être compris.

Une checklist avant d'envoyer les documents

Vérifie le type de document reçu, la date de début de l'arrêt, l'adresse de la caisse et le nom de l'employeur qui figure sur ton contrat. En intérim, ajoute les coordonnées de l'agence et la référence de mission. Garde la preuve d'envoi et vérifie ensuite que tes bulletins et messages correspondent au calendrier déclaré.

Le détail pratique de l'envoi est expliqué dans notre page sur les volets. Si la fin d'une mission approche, les informations générales sur le contrat de travail temporaire sont disponibles sur Service-Public.

Sources consultées le 31 août 2026 : ameli.fr, démarches du salarié en arrêt maladie et Service-Public, contrat de travail temporaire.

Dans cette série arrêt maladie : complément de salaire et subrogation, horaires de sortie autorisés, arrêt avec Cesu ou Pajemploi, arrêt pour dépression ou épuisement professionnel, envoi des volets de l'arrêt, temps partiel thérapeutique, congés, RTT et jours fériés, prolongation d'arrêt maladie.